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Dysbiose chez le chien : causes, symptômes, que faire
La dysbiose chez le chien est un déséquilibre des bactéries intestinales, pas une maladie à part. L’analyse des selles la détecte, on traite la cause.
Ton vétérinaire t’a donné un résultat avec la mention « dysbiose intestinale » et tu ne sais pas si c’est un diagnostic ou juste un joli mot ? Ou bien, après les antibiotiques, les selles de ton chien ne reviennent pas à la normale et tu cherches ce qui se passe dans son intestin ? La dysbiose chez le chien est un déséquilibre des bactéries intestinales qui modifie ce qu’elles font dans le ventre. Ce n’est pas une maladie à part entière, mais un constat qui peut accompagner de nombreux troubles. Tu trouveras ici ce qui la provoque, comment la reconnaître et ce que tu peux réellement faire toi-même, et ce que fait le vétérinaire.
- La dysbiose chez le chien est un changement de la composition des bactéries intestinales qui entraîne un changement de ce que les bactéries font dans l’intestin (Pilla et Suchodolski, 2020).
- Parmi les déclencheurs les mieux décrits figurent les antibiotiques, la diarrhée aiguë, les maladies intestinales chroniques et l’insuffisance du pancréas (IPE).
- La dysbiose elle-même n’a pas de symptôme typique. Elle s’accompagne par exemple de selles molles, de vomissements ou d’amaigrissement, mais ceux-ci ont de nombreuses autres causes.
- Le test Dysbiosis Index mesure 8 cibles bactériennes dans les selles. Il ne diagnostique pas de maladie, il montre seulement à quel point un échantillon diffère de celui de chiens sains.
- Il n’existe pas de méthode unique qui ramène à coup sûr les bactéries intestinales à la normale. La base est de trouver la cause et de la traiter avec le vétérinaire.
Qu’est-ce que la dysbiose chez le chien ?
La dysbiose chez le chien est un changement de la composition du microbiote intestinal qui entraîne des changements fonctionnels : les bactéries se mettent à produire d’autres substances et à remplir d’autres rôles que dans un intestin sain (Pilla et Suchodolski, 2020). On emploie parfois aussi le mot dysbactériose, qui dans le langage courant des propriétaires signifie à peu près la même chose : une flore intestinale perturbée chez le chien.
L’intestin sain du chien abrite un très grand nombre de bactéries qui aident à digérer, fabriquent des acides gras à chaîne courte et participent au traitement des acides biliaires. Une introduction au sujet se trouve dans l’article Microbiote du chien : qu’est-ce que c’est et pourquoi c’est important. Avec la dysbiose, cet état change. Dans les études sur des chiens atteints de troubles intestinaux chroniques, on trouve souvent moins de bactéries comme Faecalibacterium, Fusobacterium ou Clostridium hiranonis, et davantage d’Escherichia coli et de streptocoques (Pilla et Suchodolski, 2020).
Il est important de retenir que la « dysbiose » décrit ce qui arrive aux bactéries, pas pourquoi. C’est plutôt un constat qu’un diagnostic, et le vétérinaire se demande toujours ensuite ce qui se cache derrière.
Quelles sont les causes de la dysbiose chez le chien ?
La dysbiose chez le chien accompagne en général un autre problème ou en résulte : antibiotiques, diarrhée aiguë, maladie intestinale chronique ou maladie du pancréas. L’article Pourquoi chaque chien a un microbiote différent explique en détail pourquoi le microbiote varie d’un chien à l’autre.
| Cause ou déclencheur | Ce que l’on sait | Source |
|---|---|---|
| Antibiotiques | Les antibiotiques à large spectre réduisent rapidement la diversité des bactéries. Après l’arrêt, de nombreuses espèces reviennent. Selon la revue, un retour complet à la composition d’origine est rare, mais cette conclusion repose surtout sur des données humaines et murines. | Pilla et Suchodolski, 2020 |
| Métronidazole | Dans une étude sur 24 chiens sains, le métronidazole administré pendant 14 jours a réduit la diversité et augmenté le Dysbiosis Index. Les deux sont revenus à la normale dans les 2 semaines suivant l’arrêt, mais les Fusobacteria et, chez 7 chiens sur 16, Clostridium hiranonis n’étaient pas tout à fait revenus après 4 semaines. | Pilla et al., 2020 |
| Amoxicilline avec acide clavulanique | Chez 16 chiens atteints de diarrhée aiguë, elle n’a pas amélioré l’état clinique par rapport au placebo et le Dysbiosis Index ne différait pas, mais la proportion de souches d’E. coli résistantes a augmenté. | Werner et al., 2020 |
| Diarrhée aiguë | De tous les groupes suivis, ce sont les chiens atteints de diarrhée aiguë, surtout sanglante, qui avaient le microbiote le plus nettement modifié, davantage que les chiens atteints d’une maladie inflammatoire de l’intestin. | Suchodolski et al., 2012 |
| Entéropathie chronique | Un Dysbiosis Index supérieur à 0 concernait 74 % des chiens atteints d’inflammation chronique de l’intestin, mais seulement 5 % des chiens sains. | AlShawaqfeh et al., 2017 |
| Insuffisance du pancréas (IPE) | Les chiens atteints d’IPE ont un Dysbiosis Index plus élevé que les chiens sains, davantage d’E. coli et moins de Clostridium hiranonis. | Blake et al., 2019 |
Antibiotiques et dysbiose : ce qui se passe dans l’intestin
Les antibiotiques n’atteignent pas que l’agent de l’infection, mais aussi les bactéries intestinales bénéfiques. Chez 24 chiens sains, le métronidazole a réduit la diversité bactérienne ainsi que la présence de groupes clés, par exemple les Fusobacteria. La diversité est revenue dans les deux semaines suivant l’arrêt, mais les Fusobacteria et, chez une partie des chiens, Clostridium hiranonis n’étaient pas complètement normaux même quatre semaines après l’arrêt (Pilla et al., 2020). Pour l’amoxicilline avec acide clavulanique, une étude sur 16 chiens a constaté que le médicament n’apportait aucun bénéfice clinique dans une diarrhée aiguë non compliquée. De plus, pendant le traitement, la proportion de souches d’E. coli résistantes est montée à 100 % en médiane et restait élevée trois semaines après le traitement (Werner et al., 2020).
Il ne s’agit pas de dire que les antibiotiques sont mauvais. Quand le chien en a vraiment besoin, ils sont indispensables. Il s’agit de ne les donner que sur recommandation du vétérinaire. Pour aider l’intestin après le traitement, l’article Chien après antibiotiques fait le point.
Alimentation, stress et autres influences
La composition de l’aliment modifie le microbiote du chien : les chiens nourris avec une alimentation crue présentent souvent une répartition des bactéries différente de celle des chiens nourris aux croquettes. La revue y voit plutôt une adaptation du microbiote à l’alimentation à long terme, pas une maladie (Pilla et Suchodolski, 2020). Le stress et un changement brutal d’aliment sont des déclencheurs fréquents de diarrhée et l’intestin y réagit, comme le décrivent les articles Diarrhée de stress chez le chien et Transition alimentaire du chien.
Comment la dysbiose se manifeste-t-elle chez le chien ?
La dysbiose chez le chien n’a pas de symptôme propre. Ce que tu vois, ce sont les manifestations du problème de fond, donc le plus souvent des troubles du tube digestif. Il s’agit typiquement de selles molles, de diarrhées répétées ou alternées, de flatulences, de vomissements, de perte de poids ou d’un appétit diminué.
Les mêmes symptômes ont des dizaines d’autres causes, des parasites à l’intolérance alimentaire, c’est pourquoi on ne peut pas reconnaître la dysbiose à partir d’eux. Tu trouveras plus de détails sur chaque trouble dans les articles Troubles digestifs chez le chien, Diarrhée chez le chien ou Flatulences du chien. S’ils durent plus de 2 à 3 semaines ou reviennent, ils relèvent du vétérinaire, même si le chien est par ailleurs vif.
Comment détecte-t-on la dysbiose chez le chien ?
La dysbiose se détecte par l’analyse d’un échantillon de selles, le plus souvent par la méthode qPCR, à partir de laquelle on calcule le Dysbiosis Index. C’est un score créé à la Texas A&M University et décrit pour la première fois en 2017 (AlShawaqfeh et al., 2017).
Le Dysbiosis Index mesure la quantité de bactéries totales et de sept groupes : Faecalibacterium, Turicibacter, Escherichia coli, Streptococcus, Blautia, Fusobacterium et Clostridium hiranonis. Les valeurs négatives signifient un microbiote normal, les valeurs positives une dysbiose, et plus le chiffre est élevé, plus l’échantillon diffère d’un échantillon sain. Les valeurs de 0 à 2 sont à la limite et indiquent un léger décalage, une valeur supérieure à 2 est considérée comme une dysbiose (Suchodolski, 2021).
La seconde possibilité est le séquençage, qui décrit la diversité et la répartition des bactéries. Mais il ne dit pas à lui seul si le constat est une maladie ou un écart banal, et l’interprétation dépend du laboratoire. À quoi ressemble un tel rapport, tu le trouveras dans l’article Analyse du microbiote du chien.
Ce que le test de dysbiose ne sait pas faire
Le Dysbiosis Index ne diagnostique pas de maladie précise. Dans une étude portant sur 95 chiens sains et 106 chiens atteints d’inflammation chronique de l’intestin, il a distingué les deux groupes avec un seuil de 0, avec une sensibilité de 74 % et une spécificité de 95 % (AlShawaqfeh et al., 2017). Cela signifie qu’environ un quart des chiens atteints d’inflammation chronique de l’intestin avaient un index inférieur à zéro, donc normal. Un résultat similaire est ressorti d’un autre travail, plus petit : un Dysbiosis Index inférieur à zéro chez 82 % des chiens sains, mais aussi chez 36 % des chiens atteints d’entéropathie chronique (Blake et al., 2019).
Chez les chiots, il faut en plus de la prudence. Les chiots de moins de 5 à 6 semaines avaient un index médian de 5,39 contre −4,62 chez les chiens adultes, et les auteurs indiquent donc que les chiots de moins de 6 semaines peuvent nécessiter un autre seuil pour l’interprétation de l’index (Blake et al., 2020). L’index est donc surtout utile comme base de discussion avec le vétérinaire et pour suivre les changements dans le temps, pas comme verdict autonome.
| Ce qu’il montre | Ce qu’il ne montre pas |
|---|---|
| À quel point la composition des bactéries d’un échantillon diffère de celle de chiens sains | Un diagnostic précis ou la cause des troubles |
| Quels groupes de bactéries suivis sont bas ou élevés | Si le chien a besoin de médicaments, d’un régime, ou simplement de temps |
| Le changement entre deux échantillons dans le temps | Une valeur fiable chez les chiots de moins de 6 semaines |
Que fait le vétérinaire en cas de suspicion de dysbiose ?
Le vétérinaire cherche d’abord la cause, pas la dysbiose elle-même. Il pose des questions sur les symptômes, l’alimentation et les traitements en cours, examine le chien et, selon les besoins, prescrit des analyses de sang, une recherche de parasites dans les selles ou de l’imagerie. En cas de troubles prolongés, il peut choisir un régime d’exclusion, traiter une maladie précise, par exemple l’IPE, ou engager le bilan d’une entéropathie chronique.
Le vétérinaire ne prescrit souvent pas d’antibiotiques dans une diarrhée aiguë non compliquée. La méta-analyse sur laquelle reposent les recommandations du réseau européen ENOVAT a constaté, avec un haut niveau de certitude des preuves, que dans une diarrhée aiguë légère à modérée, ils n’aident pas de façon cliniquement significative (Scahill et al., 2024). L’article Diarrhée chez le chien développe ce point.
Ces derniers temps, on parle beaucoup de la transplantation de selles. Chez le chien, selon une revue de 2020, il manquait toutefois des études contrôlées, il n’y avait que quelques petits travaux isolés et des descriptions de cas avec des méthodes variées (Pilla et Suchodolski, 2020). C’est une méthode pour les services spécialisés, pas pour essayer à la maison.
Comment rétablir le microbiote du chien ? Ce que tu peux faire
La façon de rétablir le microbiote du chien dépend surtout de la cause, et c’est pourquoi la première étape revient toujours au vétérinaire. Il n’existe pas de méthode unique qui ramène à coup sûr les bactéries intestinales à la normale. Tu peux en revanche créer pour l’intestin les conditions pour qu’il se stabilise.
- Trouve la cause. Si les troubles durent plus de 2 à 3 semaines ou reviennent, fais examiner ton chien.
- Garde une alimentation stable. Ne change pas d’aliment sans raison et, si tu dois le faire, fais-le progressivement selon un plan de 7 à 10 jours.
- Tiens un journal des selles. Note la date, l’aspect des selles et ce que le chien a mangé. C’est plus utile au vétérinaire que la mémoire. L’article Selles du chien : couleur, forme et consistance décryptées aide à s’orienter.
- Discute des fibres avec le vétérinaire. Les fibres sont de la nourriture pour les bactéries intestinales, mais la quantité et le type reviennent au vétérinaire, surtout en cas de diarrhée. Tu en trouveras plus dans l’article Fibres pour chien.
- Ne pense aux probiotiques qu’après avis. La méta-analyse des recommandations ENOVAT n’a pas démontré de raccourcissement cliniquement significatif de la diarrhée aiguë avec les prébiotiques, les probiotiques ni les synbiotiques, avec un niveau de certitude des preuves très faible à modéré (Scahill et al., 2024). Pour savoir comment choisir, l’article Probiotiques pour chien t’explique.
- N’essaie pas de compléments ni de médicaments humains. Ce qui est courant pour une personne peut nuire au chien.
- Après les antibiotiques, laisse du temps à l’intestin. La récupération prend des semaines, pas des jours. Dans l’étude sur le métronidazole, une partie des bactéries n’était pas normale même 4 semaines après l’arrêt (Pilla et al., 2020).
Questions fréquentes
Qu’est-ce que la dysbiose chez le chien et est-elle dangereuse ?
La dysbiose chez le chien est un changement de la composition des bactéries intestinales qui modifie leurs fonctions. Elle n’est pas un diagnostic en soi, mais un constat qui peut accompagner une diarrhée, une inflammation chronique de l’intestin ou une maladie du pancréas. Ce qui est dangereux, c’est plutôt la maladie de fond, c’est pourquoi il est important de trouver la cause avec le vétérinaire.
Comment savoir si mon chien a une dysbiose ?
On ne peut pas la reconnaître à partir des symptômes, car des selles molles, des flatulences ou des vomissements ont de nombreuses causes différentes, des parasites à l’intolérance alimentaire. La dysbiose se détecte par l’analyse des selles, par exemple avec le Dysbiosis Index. Si les troubles durent plus de 2 à 3 semaines ou reviennent, fais examiner ton chien.
Un antibiotique peut-il provoquer une dysbiose ?
Oui, les antibiotiques peuvent modifier fortement le microbiote de façon temporaire. Chez des chiens sains, le métronidazole a réduit la diversité des bactéries. Elle est revenue dans les 2 semaines suivant l’arrêt, mais certains groupes de bactéries n’étaient pas normaux même après 4 semaines (Pilla et al., 2020). N’arrête jamais les antibiotiques de ta propre initiative. Si le déroulement du traitement t’inquiète, appelle le vétérinaire et décidez ensemble de la suite.
Combien de temps faut-il pour que le microbiote du chien se rétablisse ?
Il n’existe pas de durée générale. Après le métronidazole, certains groupes de bactéries n’étaient pas normaux même après 4 semaines dans l’étude sur des chiens sains (Pilla et al., 2020). Selon la revue, un retour complet à la composition d’origine est rare (cela repose sur des données humaines et murines ; Pilla et Suchodolski, 2020). Cela dépend du chien et du médicament. Surveille les selles et, en cas de doute, demande conseil au vétérinaire.
Les probiotiques aident-ils en cas de dysbiose chez le chien ?
Ce n’est pas sûr et les preuves sont pour l’instant limitées. La méta-analyse des recommandations ENOVAT n’a pas démontré de raccourcissement cliniquement significatif de la diarrhée aiguë avec les prébiotiques, les probiotiques ni les synbiotiques. Aucune des études retenues n’a toutefois signalé d’effets indésirables (Scahill et al., 2024). C’est au vétérinaire de décider s’il faut en donner et lesquels, surtout pour un chiot ou un chien malade.
La dysbiose est-elle la même chose que la dysbactériose ?
Dans le langage courant, oui. Les deux mots désignent un déséquilibre des bactéries intestinales et nous les employons de la même façon dans cet article. Dans les textes spécialisés, on utilise aujourd’hui plus souvent le terme dysbiose, c’est pourquoi tu le trouves aussi dans le titre, dans les études et dans la description des résultats de l’analyse des selles.
Sources
- Pilla R, Suchodolski JS (2020). The Role of the Canine Gut Microbiome and Metabolome in Health and Gastrointestinal Disease. Frontiers in Veterinary Science. doi.org/10.3389/fvets.2019.00498
- AlShawaqfeh MK et al. (2017). A dysbiosis index to assess microbial changes in fecal samples of dogs with chronic inflammatory enteropathy. FEMS Microbiology Ecology. doi.org/10.1093/femsec/fix136
- Pilla R et al. (2020). Effects of metronidazole on the fecal microbiome and metabolome in healthy dogs. Journal of Veterinary Internal Medicine. doi.org/10.1111/jvim.15871
- Werner M et al. (2020). Effect of amoxicillin-clavulanic acid on clinical scores, intestinal microbiome, and amoxicillin-resistant Escherichia coli in dogs with uncomplicated acute diarrhea. Journal of Veterinary Internal Medicine. doi.org/10.1111/jvim.15775
- Blake AB et al. (2019). Altered microbiota, fecal lactate, and fecal bile acids in dogs with gastrointestinal disease. PLOS ONE. doi.org/10.1371/journal.pone.0224454
- Blake AB et al. (2020). Developmental stages in microbiota, bile acids, and clostridial species in healthy puppies. Journal of Veterinary Internal Medicine. doi.org/10.1111/jvim.15928
- Suchodolski JS et al. (2012). The fecal microbiome in dogs with acute diarrhea and idiopathic inflammatory bowel disease. PLoS ONE. doi.org/10.1371/journal.pone.0051907
- Scahill K et al. (2024). Efficacy of antimicrobial and nutraceutical treatment for canine acute diarrhoea: A systematic review and meta-analysis for ENOVAT guidelines. The Veterinary Journal. doi.org/10.1016/j.tvjl.2023.106054
- Suchodolski JS (2021). Analysis of the gut microbiome in dogs and cats. Veterinary Clinical Pathology 50(S1):6–17. doi.org/10.1111/vcp.13031
Cet article est à visée éducative et ne remplace pas un examen vétérinaire. Si tu as un doute, demande conseil à ton vétérinaire.
L’article a été relu avec l’aide de l’IA. Il s’agit d’une traduction du tchèque, elle peut donc contenir des imprécisions.