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Cada perro, un microbioma distinto: por qué y qué lo moldea
Cada perro tiene un microbioma distinto por edad, dieta, origen y fármacos. En 35 perros, el individuo explicó el 39 % de las diferencias. Estudios 2018–2026.

Tienes en casa dos perros, el mismo pienso y el mismo paseo. A uno le da igual un premio nuevo; el otro, al día siguiente, tiene las heces pastosas. Una de las posibles explicaciones está en el intestino: las bacterias que viven en él cambian de un perro a otro. En 2026 se publicaron dos grandes estudios que muestran cuánto, y cuánto sigue sin saber la ciencia.
- El microbioma intestinal del perro es la comunidad de bacterias del intestino del perro, y cada perro la tiene compuesta de forma algo distinta.
- En un estudio de 35 perros sanos, la identidad de cada perro explicó el 39 % de las diferencias entre las muestras de heces (Rojas et al., 2026).
- La composición la moldean la edad, la alimentación, el origen, el entorno y los medicamentos, pero la solidez de la prueba es distinta para cada uno de esos factores.
- En un estudio de 922 perros, la diversidad bacteriana disminuía con la edad y los perros se parecían cada vez menos entre sí (Bamberger et al., 2026).
- El test de microbioma describe la composición el día de la toma de muestra, no diagnostica ninguna enfermedad y no sustituye al veterinario.
¿En qué se diferencia el microbioma de un perro del de otro?
El microbioma intestinal del perro es la comunidad de bacterias y otros microorganismos que viven en el intestino del perro y participan en la digestión. Cada perro tiene su propia composición, pero comparte parte de la comunidad con otros perros.
Un estudio de 2026 siguió a 35 perros sanos, de los que los dueños tomaron una muestra de heces aproximadamente una vez al mes durante uno o dos años. Aproximadamente el 39 % de las diferencias entre las muestras se pudo explicar por la identidad del perro (Rojas et al., 2026). El perro tiene, pues, una «firma» reconocible. Pero no es fija: el microbioma de 34 de los 35 perros fluctuó con el tiempo, aunque los perros estuvieron sanos todo el tiempo.
- 39 %de las diferencias entre las muestras de heces de 35 perros sanos se pudo explicar por la identidad del perro.Rojas et al., 2026
- 240 especiesforman el núcleo común que, en un conjunto de datos independiente, correspondía a más del 80 % del microbioma intestinal del perro.Castillo-Fernandez et al., 2026
- hasta el 95 %del ADN de las heces de perro se pudo asignar a bacterias con el nuevo catálogo, frente a solo un 25 % aproximadamente con las bases de datos públicas.Castillo-Fernandez et al., 2026
- 922 perrosparticiparon en el estudio estadounidense que investigó la influencia de la edad y del estilo de vida en perros de 8 meses a 18 años.Bamberger et al., 2026
¿Cuánto sabe la ciencia sobre las bacterias intestinales del perro?
Hasta hace poco, con las bases de datos públicas de genomas bacterianos los científicos solo lograban asignar a una bacteria conocida aproximadamente una cuarta parte del ADN de las heces de perro. El resto pertenecía a bacterias que nadie sabía nombrar. Por eso las diferencias entre perros solo se medían de forma aproximada.
En enero de 2026 se publicó en la revista Microbiome un nuevo catálogo canino. Los autores leyeron el ADN de 501 muestras de heces de 107 perros sanos de EE. UU. y Europa y encontraron 89 especies hasta entonces desconocidas y 10 géneros nuevos de bacterias. Gracias a ello, la proporción de ADN asignado subió hasta el 95 %, desde un 25 % aproximadamente (Castillo-Fernandez et al., 2026). El intestino del perro no es, pues, una versión reducida del humano; simplemente lo hemos mirado durante mucho tiempo con gafas humanas.
¿Qué moldea el microbioma de un perro?
La composición del microbioma del perro la moldean la edad, la alimentación, el origen, el entorno y los medicamentos. Pero los distintos factores no están documentados igual de bien, por eso la tabla está dividida según la solidez de la prueba.
| Factor | Qué mostró el estudio en perros | Solidez de la prueba |
|---|---|---|
| Alimentación | Dos alimentos con distinta proporción de proteínas y carbohidratos cambiaron la composición del microbioma en 64 perros de dos razas en 4 semanas, con independencia de la raza y del sexo (Coelho et al., 2018) | Buena (grupos asignados al azar) |
| Medicamentos | En un estudio de 24 perros sanos, 16 de ellos recibieron durante 14 días el antibiótico metronidazol. La composición del microbioma cambió y ni 4 semanas después de suspenderlo volvió del todo (Pilla et al., 2020) | Media (estudio controlado pequeño sin asignación al azar) |
| Edad | En 922 perros, la diversidad disminuía con la edad y los perros se parecían menos entre sí (Bamberger et al., 2026) | Media (perros distintos en un único momento) |
| Origen y camada | Los hermanos de una misma camada tenían un microbioma más parecido que los perros sin parentesco, de forma más marcada a las 7 semanas, cuando todavía vivían juntos (Vilson et al., 2018) | Media (una sola raza, 168 perros) |
| Lugar de residencia | Los perros de grandes ciudades tenían mayor diversidad que los del campo (Vilson et al., 2018) | Más débil (una sola raza, motivo desconocido) |
| Tiempo y estación del año | El microbioma de los perros sanos fluctúa con el tiempo y algunas bacterias tienen variaciones estacionales (Rojas et al., 2026) | Media (35 perros) |
De la tabla se desprende una cosa práctica: dos perros pueden reaccionar de forma distinta al mismo alimento o premio, y una de las posibles razones es un microbioma diferente. Pero si los problemas duran o se repiten, consulta con el veterinario. Cómo hacer un cambio de alimentación con suavidad lo encontrarás en el artículo Cambio de pienso en perros: plan de 7 a 10 días, y sobre la influencia del tratamiento en el intestino trata el artículo Perro después de los antibióticos: cómo apoyar su barriguita.
¿Cómo cambia el microbioma desde el cachorro hasta el perro mayor?
El microbioma del perro cambia con la edad: en el cachorro se desarrolla con rapidez, en el adulto sigue fluctuando y en los perros mayores es menos diverso y más individual. Lo muestran estudios de los tres periodos, pero cada uno tiene limitaciones distintas.
- Cachorro. Un trabajo de revisión de 2022 describe que la composición de las bacterias intestinales cambia con rapidez en el desarrollo temprano y que las bacterias importantes colonizan el intestino de forma gradual, hasta que el cachorro se hace adulto (Garrigues et al., 2022). En un estudio de 168 pastores alemanes, un cachorro de 7 semanas se parecía más a su madre que a una perra ajena (al comparar con las muestras de las perras 7 semanas después del parto, no en el parto) y los hermanos de una camada se parecían más entre sí que los perros sin parentesco. Entre las 7 semanas y los 15 a 18 meses, tanto la diversidad como la composición siguieron cambiando (Vilson et al., 2018).
- Perro adulto. Tampoco en el perro adulto se detiene la composición. En 35 perros sanos fluctuaba de un mes a otro y algunas bacterias tenían patrones estacionales (Rojas et al., 2026). En el estudio estadounidense de perros de 8 meses a 18 años, la composición se fue desplazando poco a poco al aumentar la edad (Bamberger et al., 2026).
- Perro mayor. Al aumentar la edad, la diversidad de bacterias disminuía y el microbioma del perro era más distinto del de los demás perros (Bamberger et al., 2026). Un estudio japonés más antiguo, que cultivaba las bacterias en el laboratorio, observó que el número y la presencia de lactobacilos tendían a disminuir con la edad (Masuoka et al., 2017).
¿Qué significa todo esto para tu perro?
El hecho de que cada microbioma sea distinto significa sobre todo paciencia: no tiene sentido comparar a tu perro con el de otro, y los cambios hazlos despacio. Prueba estos cuatro pasos.
- No compares. Lo que funciona con el perro de la calle de al lado puede no funcionar con el tuyo. La diferencia no tiene por qué significar que hagas algo mal.
- Cambia poco a poco. Introduce el alimento nuevo y los premios por partes, para que el intestino tenga tiempo de adaptarse.
- Apunta. Un diario breve de heces, comidas y premios te mostrará al cabo de semanas a qué reacciona tu perro. Cómo leer las heces lo encontrarás en el artículo Heces del perro: qué revelan color, forma y consistencia.
- Cuenta con la edad. Cuando el perro pasa de cachorro a adulto y más tarde a perro mayor, consulta con el veterinario sobre la alimentación y qué vigilar.
¿Qué sigue sin saber la ciencia sobre el microbioma del perro?
La ciencia todavía no sabe decir qué composición es la correcta para un perro concreto. Sabemos que los perros se diferencian, pero no cuál de esas diferencias es una variación sana y cuál una señal de alarma.
- Qué es «normal» para un perro. Los estudios comparan grupos de perros. Para un perro individual falta un límite claro.
- Por qué se diferencian los perros. En los estudios, la edad, la alimentación o el lugar de residencia se asocian al microbioma, pero a menudo no se determina la causa.
- Si elegir los probióticos según la composición funciona mejor. Una mayor eficacia de los probióticos elegidos según el microbioma, en comparación con los probióticos habituales, todavía no está demostrada de forma fiable.
Preguntas frecuentes
¿Tiene cada perro un microbioma distinto?
Sí, cada perro tiene una composición algo distinta de bacterias intestinales, pero comparte parte de la comunidad con otros perros. En un estudio de 35 perros sanos, la identidad de cada perro explicó el 39 % de las diferencias entre las muestras (Rojas et al., 2026). Además, el microbioma de un mismo perro cambia con el tiempo.
¿Tienen el mismo microbioma los hermanos de una camada?
No, solo uno más parecido. En un estudio de 168 pastores alemanes de 30 camadas, los hermanos de una misma camada tenían una composición de bacterias en las heces más parecida que los perros sin parentesco, pero no idéntica. Se parecían más a las 7 semanas, cuando todavía vivían juntos. También hubo cambios entre las 7 semanas y los 15 a 18 meses de vida (Vilson et al., 2018).
¿Cambia el microbioma del perro con la edad?
Sí. En un estudio de 922 perros de 8 meses a 18 años, la diversidad bacteriana disminuía con la edad y los perros se parecían menos entre sí (Bamberger et al., 2026). Pero el estudio comparó perros distintos en un único momento, no los mismos perros a lo largo de toda la vida.
¿Puede la alimentación cambiar el microbioma del perro?
Sí. En un estudio de 64 perros de dos razas, dos alimentos con distinta proporción de proteínas y carbohidratos cambiaron la composición del microbioma en 4 semanas, con independencia de la raza o del sexo. En perros con sobrepeso, los cambios fueron mayores tras el alimento con alta proporción de proteínas (Coelho et al., 2018).
¿Es el microbioma del perro igual que el humano?
No. El microbioma del perro se parece más al humano que al del cerdo o al del ratón (Coelho et al., 2018), pero es singular. El nuevo catálogo de 2026 describió 89 especies de bacterias hasta entonces desconocidas del intestino del perro y elevó la proporción de ADN asignado desde un 25 % aproximadamente hasta el 95 % (Castillo-Fernandez et al., 2026).
¿Se puede medir el microbioma de mi perro?
Sí, a partir de una muestra de heces frescas. El laboratorio describe qué bacterias viven en el intestino el día de la toma de muestra. Como el microbioma de un perro sano fluctúa con el tiempo, un solo análisis recoge solo un momento (Rojas et al., 2026). El resultado no establece un diagnóstico ni sustituye al veterinario; es una base para hablar con él.
Fuentes
- Rojas CA et al. (2026). Temporal variability is an inherent feature of the healthy canine microbiome assessed by full-length 16S rRNA gene sequencing. Animal Microbiome. doi.org/10.1186/s42523-026-00546-9
- Castillo-Fernandez J et al. (2026). Waltham catalogue for the canine gut microbiome: a complete taxonomic and functional catalogue of the canine gut microbiome through novel metagenomic based genome discovery. Microbiome. doi.org/10.1186/s40168-025-02265-w
- Bamberger T et al. (2026). Mapping the canine gut microbiome: insights from the Dog Aging Project. Nature Communications. doi.org/10.1038/s41467-026-73193-y
- Vilson Å et al. (2018). Disentangling factors that shape the gut microbiota in German Shepherd dogs. PLOS ONE. doi.org/10.1371/journal.pone.0193507
- Garrigues Q et al. (2022). Gut microbiota development in the growing dog: A dynamic process influenced by maternal, environmental and host factors. Frontiers in Veterinary Science. doi.org/10.3389/fvets.2022.964649
- Masuoka H et al. (2017). Transition of the intestinal microbiota of dogs with age. Bioscience of Microbiota, Food and Health. doi.org/10.12938/bmfh.bmfh-2016-021
- Coelho LP et al. (2018). Similarity of the dog and human gut microbiomes in gene content and response to diet. Microbiome. doi.org/10.1186/s40168-018-0450-3
- Pilla R et al. (2020). Effects of metronidazole on the fecal microbiome and metabolome in healthy dogs. Journal of Veterinary Internal Medicine. doi.org/10.1111/jvim.15871
El artículo es educativo y no sustituye la revisión veterinaria. Si tienes dudas, consulta con tu veterinario.
El artículo ha sido revisado con ayuda de IA. Es una traducción del checo, por lo que puede contener imprecisiones.