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Análisis del microbioma del perro: qué muestra el resultado

El test de microbioma del perro muestra las bacterias de las heces, no un diagnóstico. Cómo elegirlo, hacer la recogida y leer el resultado con el veterinario.

27. 9. 2026Actualizado 17. 10. 202615 min de lecturaTom Tomčo, asesor del microbioma canino

Un laboratorio con luz cálida, una gradilla con tubos de ensayo y una pipeta.

Hoy casi cualquiera puede hacerle un test de microbioma a su perro: envías una muestra de heces por correo y a las pocas semanas te llega un informe lleno de nombres en latín. Antes de lanzarte, conviene saber qué puedes sacar de él. Y, siendo honestos, también lo que el análisis no puede hacer.

En resumen
  • El test de microbioma a partir de las heces del perro muestra qué bacterias viven en el intestino y si su composición se aleja de la de los perros sanos.
  • El resultado no establece un diagnóstico ni sustituye al veterinario: es una base para hablar con él.
  • Los laboratorios usan tres métodos principales (secuenciación del 16S rRNA, metagenómica shotgun y qPCR con Dysbiosis Index) y sus resultados no se pueden comparar sin más.
  • Antes de la recogida, cuéntales al laboratorio y al veterinario si tu perro ha tomado antibióticos o probióticos o si ha cambiado de comida, porque influyen en el resultado.
  • Al elegir un test, comprueba el método, la comparación con perros sanos, quién te explica el resultado y que el test no pretenda dar un diagnóstico. Además, un resultado es una foto de un día, así que sigue la evolución en el mismo laboratorio.

Qué muestra el análisis

El análisis de heces describe la composición de las bacterias intestinales del perro el día de la recogida. Es una base útil para hablar con el veterinario.

  1. Quién vive en el intestino. Qué bacterias hay, qué variedad tiene su comunidad y qué podrían hacer.
  2. Desviación de la composición habitual. A esto se le llama disbiosis. Los veterinarios usan para ello, por ejemplo, el Dysbiosis Index, que mide la cantidad total de bacterias y 7 grupos clave y los compara con los valores de perros sanos.
  3. Cómo cambia el microbioma con el tiempo. La medición repetida muestra la evolución, por ejemplo tras un cambio de comida o después de un tratamiento.

Qué no muestra el análisis

  • Un diagnóstico. La disbiosis es una pista, no una enfermedad. Cambios parecidos pueden tener varias causas.
  • Un sustituto del veterinario. Tiene sentido interpretar el resultado junto con los síntomas y otras exploraciones.
  • Parásitos. El test de microbioma no está pensado para buscar parásitos. Para los huevos y los quistes sirve el análisis de heces y, en el caso de Giardia, también una prueba a partir de una muestra de heces (Merck Veterinary Manual).
  • Una comparación fácil entre laboratorios. Los métodos de secuenciación todavía no están unificados, así que los resultados de dos laboratorios distintos no se pueden comparar sin más.

¿Qué métodos usan los laboratorios?

Los laboratorios analizan las heces del perro sobre todo de tres maneras: secuenciando el gen 16S rRNA, con metagenómica shotgun y con PCR cuantitativa (qPCR) con Dysbiosis Index. Se diferencian en la profundidad con la que miran y en la referencia con la que comparan el resultado.

La secuenciación del 16S rRNA lee en cada bacteria un único gen común, algo así como el «nombre en el timbre». La metagenómica shotgun lee todo el ADN de la muestra. La qPCR no busca todas las bacterias, solo cuenta grupos elegidos de antemano.

Los tres métodos principales de análisis de heces del perro
Método Qué mide Punto fuerte Limitación
Secuenciación del 16S rRNA Un gen de todas las bacterias; el resultado es una lista de bacterias y su proporción relativa Visión amplia Los procedimientos no están unificados y ve sobre todo las bacterias más frecuentes
Metagenómica shotgun Todo el ADN de la muestra, es decir, las bacterias y sus genes Ve también bacterias más raras y posibles funciones Más cara, también sin procedimientos unificados
qPCR con Dysbiosis Index Cantidad total de bacterias y 7 grupos elegidos; el resultado es un solo número Tiene un intervalo de referencia de perros sanos No muestra las bacterias fuera de los grupos elegidos

Según una revisión sobre el análisis del microbioma canino, los métodos se diferencian en lo que son capaces de detectar (Suchodolski, 2021). De forma parecida, en el intestino de pollo (los datos no son de perros), la secuenciación del 16S captó solo una parte de la comunidad que la metagenómica shotgun reveló, sobre todo en las bacterias menos abundantes (Durazzi et al., 2021). El Dysbiosis Index, en cambio, está validado directamente en perros: en un trabajo con muestras de 95 perros sanos y 106 perros con enfermedad inflamatoria crónica del intestino distinguió correctamente al 95 % de los sanos y al 74 % de los enfermos (AlShawaqfeh et al., 2017).

Por qué difieren los resultados de los laboratoriosLa secuenciación varía en los procedimientos y en la evaluación, le falta estandarización y todavía no se ha comprobado con precisión hasta qué punto se repiten sus resultados (Suchodolski, 2021). Además, los procedimientos evolucionan con el tiempo incluso dentro de un mismo laboratorio. Por eso haz las mediciones repetidas en el mismo laboratorio y pregunta si entretanto ha cambiado de método.

¿Qué significan los términos del resultado?

El informe del laboratorio suele incluir la diversidad, la abundancia relativa y la valoración de la disbiosis. Cada uno de estos términos significa algo distinto, y un número suelto sin contexto no dice nada.

  • La diversidad indica cuántas bacterias distintas viven en el intestino y lo equilibradas que están. Un número más alto no significa por sí solo mejor salud. En perros sanos, tras 14 días de metronidazol (un antibiótico), la riqueza de las bacterias intestinales disminuyó de forma notable (Pilla et al., 2020).
  • La abundancia relativa es la proporción de una bacteria sobre el total, por ejemplo un 12 %. No dice cuántas bacterias hay exactamente en el intestino, solo qué parte del conjunto representa. Cuando un grupo crece, la proporción de los demás baja automáticamente.
  • La disbiosis es un desequilibrio de las bacterias intestinales en el que cambia la composición o la función de la comunidad respecto a los perros sanos (Suchodolski, 2021). Es la descripción de un estado, no un diagnóstico ni una prueba de enfermedad.
  • El Dysbiosis Index resume el resultado de la qPCR en un solo número: un valor negativo indica una composición habitual y uno positivo, disbiosis (AlShawaqfeh et al., 2017).
Una foto de un momentoEl microbioma cambia con la alimentación, los medicamentos y el tiempo. Por eso cada resultado muestra el estado del día de la recogida, no para siempre.

Cuándo tiene sentido hacer el test

Cuándo ir al veterinario de inmediatoLos problemas agudos van directamente al veterinario, no al laboratorio. Si la diarrea dura más de uno o dos días, hay sangre en las heces o las heces son negras, el perro vomita repetidamente o está decaído, llama al veterinario de inmediato. En cachorros, perros mayores y perros con una enfermedad crónica, consulta también ante molestias más leves.

¿Cómo elegir un test de microbioma para perros?

Al elegir un test de microbioma para perros, comprueba el método, con qué compara el laboratorio el resultado, qué contiene el informe, quién te lo explica, cómo funcionan la recogida y el envío de la muestra y si el test pretende dar un diagnóstico. Busca las respuestas antes de hacer el pedido, no después.

Criterios para elegir un test de microbioma para perros
Criterio Qué preguntar Por qué importa
Método ¿Secuenciación del 16S rRNA, metagenómica shotgun o qPCR con Dysbiosis Index? Los métodos ven cosas distintas y sus resultados no se pueden comparar sin más (Suchodolski, 2021). El laboratorio debería indicar claramente su método.
Comparación con un grupo de referencia ¿Con qué valores de perros sanos se compara tu perro? El Dysbiosis Index tiene intervalos de referencia establecidos para perros (Suchodolski, 2021). Una lista de bacterias sin comparación es difícil de leer.
Contenido del informe ¿Incluye la diversidad, la proporción de los grupos de bacterias y la explicación de los términos, o solo un número? La diversidad, la proporción y la valoración de la disbiosis significan cada una algo distinto. Un solo número sin contexto no basta.
Quién explica el resultado ¿Te lo explica un especialista o solo recibes un informe lleno de nombres latinos? El resultado solo tiene sentido junto con los síntomas del perro. Al final lo repasarás de todos modos con el veterinario.
Recogida en casa y envío ¿Trae el kit instrucciones claras sobre qué hacer con la muestra y cómo enviarla? El procedimiento del laboratorio siempre prevalece sobre los consejos generales. Una muestra mal manipulada es una base menos fiable.
Plazo de procesamiento ¿Cuánto tarda en llegar el resultado desde que llega la muestra? La rapidez no es el criterio principal, pero conviene saber de antemano cuándo esperar el resultado y cuándo podrás comentarlo con el veterinario.
Sin diagnóstico ¿El test afirma detectar una enfermedad o promete una curación? La disbiosis describe el estado de las bacterias, no es el diagnóstico de una enfermedad. Un test serio no debe hacerse pasar por una exploración veterinaria.
Repetición ¿Se puede repetir el test más adelante con el mismo método? El microbioma varía de forma natural con el tiempo (Rojas et al., 2026), así que la evolución en el mismo laboratorio dice más que una sola medición.

Cómo son con nosotros la recogida, el resultado y la explicación lo encontrarás en la página Test de microbioma para perros. Aquí es más bien una guía para comparar por tu cuenta ofertas parecidas.

¿Cómo prepararse para la recogida?

Antes de la recogida, anota qué toma y qué come el perro, y sigue exactamente las instrucciones del laboratorio. Los antibióticos, los probióticos y un cambio de comida pueden desplazar el resultado, así que cuéntaselo al laboratorio y al veterinario.

  1. Anota los medicamentos. Los antibióticos pueden cambiar las bacterias intestinales durante bastante tiempo: en perros sanos, tras 14 días de metronidazol, los cambios no se habían resuelto del todo ni cuatro semanas después de suspenderlo (Pilla et al., 2020). Anota el nombre del medicamento y cuándo terminó el tratamiento.
  2. Anota los probióticos y otros suplementos. No los suspendas por tu cuenta sin consultar. Si conviene omitirlos antes de la recogida, lo deciden el laboratorio y el veterinario según lo que se quiera averiguar.
  3. Anota el cambio de comida. En un estudio, cuando perros sanos pasaron de forma gradual de pienso seco a una dieta con mucha carne de vacuno cocida, cambió la composición de las bacterias de las heces y, al volver al pienso seco, regresó en gran parte a su estado original (Herstad et al., 2017). Si la comida ha cambiado en las últimas semanas, indícalo.
  4. Recoge una muestra fresca. Hazlo en casa, en el kit de recogida, exactamente según las instrucciones, y envíala al laboratorio.

Los requisitos exactos varían según el laboratorio, así que las instrucciones del envase siempre tienen prioridad sobre un consejo general.

¿Por qué un solo resultado no basta?

El microbioma de un perro sano cambia de forma natural con el tiempo, así que una medición solo muestra un día. Solo repetirla en el mismo laboratorio indica si se trata de una desviación duradera o de una fluctuación normal.

Un estudio con 35 perros sanos a los que los científicos recogieron heces cada mes durante uno o dos años mostró que cada perro mantenía su propio perfil típico, pero que su microbioma variaba de forma marcada con el tiempo. Algunas bacterias, como Escherichia coli, estuvieron entre las más variables; otras, como Peptacetobacter hiranonis, fueron más estables (Rojas et al., 2026).

  • Mide en el mismo laboratorio. Si no, comparas dos métodos distintos, no dos estados del intestino.
  • Lee la tendencia, no un número suelto. Importa más la dirección del cambio que una pequeña desviación.

¿Cómo revisar el resultado con el veterinario?

Lleva el resultado al veterinario junto con lo que observas en tu perro, porque solo juntos tienen sentido. El laboratorio describe las bacterias; el veterinario valora al perro y decide los siguientes pasos.

  1. Lleva la documentación. El informe del laboratorio, la lista de medicamentos y suplementos, los datos de la alimentación y un breve registro de las heces y del apetito.
  2. Pregunta por la relación con los síntomas. ¿Qué partes del informe se corresponden con los problemas del perro y cuáles son solo una desviación?
  3. Acuerda el siguiente paso. El veterinario puede recomendar otras exploraciones, un ajuste de la alimentación o una recogida de control.
  4. Elige los probióticos según los datos. Si el veterinario recomienda probióticos, el resultado puede servir de base para elegir, en lugar de hacerlo a ojo. Pero por ahora faltan estudios en perros que demuestren que elegir según el análisis funcione mejor.

Qué preguntarle al laboratorio

  • ¿Con qué método analiza la muestra?
  • ¿Con qué compara el resultado, es decir, con qué valores de perros sanos?
  • ¿Cuánto tardan los resultados y quién los interpreta?
  • ¿Qué debo contarle al laboratorio antes de la recogida (medicamentos, comida, suplementos)?

Un buen laboratorio te lo explicará con gusto. Qué es el microbioma canino lo encuentras en el artículo Microbioma del perro: qué es y por qué importa.

Preguntas frecuentes

¿Detecta el test de microbioma una enfermedad en el perro?

No. El test muestra qué bacterias viven en el intestino y si su composición se diferencia de la de los perros sanos. Pero la disbiosis es solo una pista, no una enfermedad, y cambios parecidos pueden tener varias causas. El diagnóstico solo lo establece el veterinario, junto con los síntomas y otras exploraciones. El resultado del test puede servirle como un dato más.

¿Cómo se hace el test de microbioma en un perro?

A partir de una muestra de heces frescas. La recoges en casa con el kit de recogida siguiendo exactamente las instrucciones del laboratorio y la envías para su análisis. Antes, anota los medicamentos, los suplementos y los cambios de comida, porque influyen en el resultado. El resultado te llega como un informe sobre la composición del microbioma, que conviene comentar con el veterinario.

¿Por qué difieren los resultados de distintos laboratorios?

Los métodos de secuenciación todavía no están unificados y varían en el procedimiento y en la evaluación. Tampoco se ha comprobado con precisión hasta qué punto se repiten sus resultados, y los laboratorios difieren también en cómo presentan los resultados. Por eso los resultados de dos laboratorios no se pueden comparar sin más, y lo mejor es hacer las mediciones repetidas en el mismo laboratorio.

¿Qué diferencia hay entre la secuenciación del 16S rRNA, la metagenómica shotgun y la qPCR?

La secuenciación del 16S rRNA lee un gen de las bacterias y determina qué bacterias hay en la muestra y en qué proporción. La metagenómica shotgun lee todo el ADN, así que detecta también bacterias menos abundantes y sus posibles funciones. La qPCR con Dysbiosis Index cuenta solo la cantidad total de bacterias y siete grupos elegidos, y los compara con los valores de perros sanos.

¿Debo suspender los probióticos o cambiar la comida de mi perro antes de la recogida?

No cambies nada por tu cuenta. Cuéntales al veterinario y al laboratorio qué toma el perro y con qué lo alimentas, y sigue sus indicaciones. Los antibióticos, los probióticos y un cambio de comida pueden influir en la composición del microbioma, los antibióticos incluso durante varias semanas. Si conviene suspender un suplemento antes de la recogida, lo decide el veterinario según lo que se quiera averiguar.

¿Cada cuánto se debe repetir el test?

Depende del motivo del test. El microbioma de un perro sano varía de forma natural con el tiempo, así que una sola medición es apenas una foto de un día. Por eso planifica el control con el veterinario, por ejemplo unas semanas después de un cambio de comida o de un tratamiento, y mide en el mismo laboratorio. Importa más la dirección del cambio que un solo número.

¿Qué diferencia hay entre un test de microbioma y un análisis de heces para buscar parásitos?

El análisis de heces para buscar parásitos busca huevos, quistes o antígenos de parásitos, por ejemplo de Giardia. El test de microbioma describe la composición de las bacterias intestinales y no está pensado para buscar parásitos. Uno no sustituye al otro y un solo resultado negativo no descarta los parásitos, por eso ante molestias el veterinario puede plantearse repetir la toma de muestras (Merck Veterinary Manual).

Fuentes

  1. Suchodolski JS (2021). Analysis of the gut microbiome in dogs and cats. Veterinary Clinical Pathology. doi.org/10.1111/vcp.13031
  2. AlShawaqfeh MK et al. (2017). A dysbiosis index to assess microbial changes in fecal samples of dogs with chronic inflammatory enteropathy. FEMS Microbiology Ecology. doi.org/10.1093/femsec/fix136
  3. Herstad KMV et al. (2017). A diet change from dry food to beef induces reversible changes on the faecal microbiota in healthy, adult client-owned dogs. BMC Veterinary Research. doi.org/10.1186/s12917-017-1073-9
  4. Pilla R et al. (2020). Effects of metronidazole on the fecal microbiome and metabolome in healthy dogs. Journal of Veterinary Internal Medicine. doi.org/10.1111/jvim.15871
  5. Durazzi F et al. (2021). Comparison between 16S rRNA and shotgun sequencing data for the taxonomic characterization of the gut microbiota. Scientific Reports. doi.org/10.1038/s41598-021-82726-y
  6. Rojas CA et al. (2026). Temporal variability is an inherent feature of the healthy canine microbiome assessed by full-length 16S rRNA gene sequencing. Animal Microbiome. doi.org/10.1186/s42523-026-00546-9
  7. Merck Veterinary Manual. Diagnostic Procedures for the Private Practice Laboratory: Parasitology (análisis de heces, Giardia, repetición del examen). merckvetmanual.com

El artículo es educativo y no sustituye la revisión veterinaria. Si tienes dudas, consulta con tu veterinario.
El artículo ha sido revisado con ayuda de IA. Es una traducción del checo, por lo que puede contener imprecisiones.

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