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Analisi del microbioma del cane: cosa mostra il risultato
Il test del microbioma del cane mostra i batteri delle feci, non una diagnosi. Come sceglierlo, fare il prelievo e leggere il risultato con il veterinario.
Il test del microbioma del cane oggi è accessibile quasi a tutti: spedisci per posta un campione di feci e dopo qualche settimana ricevi un referto pieno di nomi latini. Prima di iniziare vale la pena sapere che cosa ne puoi ricavare. Con onestà, anche riguardo a ciò che l’analisi non può fare.
- Il test del microbioma sulle feci del cane mostra quali batteri vivono nell’intestino e se la loro composizione si discosta da quella dei cani sani.
- Il risultato non stabilisce una diagnosi e non sostituisce il veterinario: è una base per il confronto con il veterinario.
- I laboratori usano tre metodi principali (sequenziamento 16S rRNA, metagenomica shotgun e qPCR con Dysbiosis Index) e i loro risultati non sono facilmente confrontabili.
- Prima del prelievo parla con il laboratorio e con il veterinario di antibiotici, probiotici e cambi di alimentazione, perché influenzano il risultato.
- Quando scegli un test, verifica il metodo, il confronto con cani sani, chi ti spiega il risultato e se il test non pretende di fare una diagnosi. Un solo risultato è inoltre un’istantanea di un giorno, perciò segui l’andamento nello stesso laboratorio.
Che cosa mostra l’analisi
L’analisi delle feci descrive la composizione dei batteri intestinali del cane nel giorno del prelievo. Per il confronto con il veterinario è una base utile.
- Chi vive nell’intestino. Quali batteri ci sono, quanto è varia la loro comunità e che cosa potrebbero saper fare.
- Lo scostamento dalla composizione abituale. Si chiama disbiosi. I veterinari si servono per esempio del Dysbiosis Index, che misura la quantità totale di batteri e 7 gruppi chiave e li confronta con i valori dei cani sani.
- Come cambia il microbioma nel tempo. Misurazioni ripetute mostrano l’evoluzione, per esempio dopo un cambio di alimentazione o dopo una terapia.
Che cosa l’analisi non mostra
- Una diagnosi. La disbiosi è una traccia, non una malattia. Cambiamenti simili possono avere più cause.
- Un sostituto del veterinario. Il risultato ha senso se interpretato insieme ai sintomi e agli altri esami.
- I parassiti. Il test del microbioma non è pensato per cercare parassiti. Per uova e cisti serve l’esame delle feci e, per la Giardia, anche un test su un campione di feci (Merck Veterinary Manual).
- Un confronto facile tra laboratori. I metodi di sequenziamento non sono ancora uniformi, perciò i risultati di due laboratori diversi non si possono confrontare semplicemente.
Quali metodi usano i laboratori?
I laboratori analizzano le feci del cane più spesso in tre modi: con il sequenziamento del gene 16S rRNA, con la metagenomica shotgun e con la PCR quantitativa (qPCR) con Dysbiosis Index. Differiscono per la profondità dell’analisi e per i valori con cui confrontano il risultato.
Il sequenziamento 16S rRNA legge di ogni batterio un solo gene comune, una specie di «nome sul campanello». La metagenomica shotgun legge tutto il DNA presente nel campione. La qPCR non cerca tutti i batteri, ma conta soltanto gruppi scelti in anticipo.
| Metodo | Che cosa misura | Punto di forza | Limite |
|---|---|---|---|
| Sequenziamento 16S rRNA | Un gene di tutti i batteri; il risultato è un elenco di batteri e della loro abbondanza relativa | Ampia panoramica | Procedure non uniformi, vede soprattutto i batteri più frequenti |
| Metagenomica shotgun | Tutto il DNA del campione, cioè i batteri e i loro geni | Vede anche batteri più rari e le possibili funzioni | Più costosa, anch’essa senza procedure uniformi |
| qPCR con Dysbiosis Index | La quantità totale di batteri e 7 gruppi selezionati; il risultato è un unico numero | Ha un intervallo di riferimento dei cani sani | Non mostra i batteri al di fuori dei gruppi selezionati |
Secondo una rassegna sull’analisi del microbioma canino, i metodi differiscono in ciò che riescono a cogliere (Suchodolski, 2021). In modo simile, sull’intestino di pollo (i dati non provengono da cani) il sequenziamento 16S ha colto solo una parte della comunità che la metagenomica shotgun ha rivelato, soprattutto per i batteri meno abbondanti (Durazzi et al., 2021). Il Dysbiosis Index, invece, è stato validato direttamente sui cani: in un lavoro con campioni di 95 cani sani e 106 cani con malattia infiammatoria cronica intestinale ha distinto correttamente il 95% dei cani sani e il 74% dei malati (AlShawaqfeh et al., 2017).
Che cosa significano i termini del risultato?
Il referto del laboratorio di solito contiene la diversità, l’abbondanza relativa e la valutazione della disbiosi. Ognuno di questi termini significa una cosa diversa e un numero da solo, senza contesto, non dice nulla.
- La diversità indica quanti batteri diversi vivono nell’intestino e quanto equilibrata sia la loro presenza. Un numero più alto di per sé non significa una salute migliore. Nei cani sani, dopo 14 giorni di metronidazolo (un antibiotico) la ricchezza dei batteri intestinali è diminuita in modo marcato (Pilla et al., 2020).
- L’abbondanza relativa è la quota di un batterio sul totale, per esempio il 12%. Non dice quanti batteri ci siano esattamente nell’intestino, ma solo quanto pesa sul totale. Quando un gruppo cresce, la quota degli altri diminuisce automaticamente.
- La disbiosi è uno squilibrio dei batteri intestinali in cui la composizione o la funzione della comunità cambia rispetto ai cani sani (Suchodolski, 2021). È la descrizione di uno stato, non una diagnosi né la prova di una malattia.
- Il Dysbiosis Index riassume il risultato della qPCR in un solo numero: un valore negativo indica una composizione normale, uno positivo una disbiosi (AlShawaqfeh et al., 2017).
Quando il test ha senso
- I disturbi digestivi si ripresentano. Le feci sono ripetutamente molli e con il veterinario cercate la causa. Il risultato offrirà al veterinario un’ulteriore base. Di più negli articoli Feci del cane: cosa rivelano colore, forma e consistenza e Feci molli nel cane: cause e cosa fare.
- Dopo gli antibiotici. Vuoi sapere come si sta riprendendo l’intestino dopo la terapia. Vedi Cane dopo gli antibiotici: come sostenere la sua pancia.
- Cambio di alimentazione. Misurazioni ripetute mostrano come evolve il microbioma dopo il cambio di dieta. Vedi Cambio di alimentazione nel cane: piano da 7 a 10 giorni.
- Scelta dei probiotici. Vuoi scegliere in base ai dati e non in base a ciò che è in offerta. Vedi Probiotici per cani: cosa sono e come sceglierli.
Come scegliere un test del microbioma del cane?
Quando scegli un test del microbioma del cane, verifica il metodo, con che cosa il laboratorio confronta il risultato, che cosa contiene il referto, chi te lo spiega, come funzionano il prelievo e la spedizione e se il test non pretende di fare una diagnosi. Cerca le risposte prima di ordinare, non dopo.
| Criterio | Che cosa chiedere | Perché è importante |
|---|---|---|
| Metodo | Sequenziamento 16S rRNA, metagenomica shotgun o qPCR con Dysbiosis Index? | I metodi vedono cose diverse e i loro risultati non si possono confrontare semplicemente (Suchodolski, 2021). Il laboratorio dovrebbe indicare chiaramente il metodo. |
| Confronto con un gruppo di riferimento | Con quali valori di cani sani viene confrontato il tuo cane? | Il Dysbiosis Index ha intervalli di riferimento stabiliti per i cani (Suchodolski, 2021). Un elenco di batteri senza confronto è difficile da leggere. |
| Contenuto del referto | Include la diversità, la presenza dei gruppi di batteri e la spiegazione dei termini, oppure un solo numero? | Diversità, presenza dei gruppi e valutazione della disbiosi significano ciascuna qualcosa di diverso. Un solo numero senza contesto non basta. |
| Chi spiega il risultato | Ricevi la spiegazione di un esperto o solo un rapporto pieno di nomi latini? | Il risultato ha senso solo insieme ai sintomi del cane. Alla fine lo ripassi comunque con il veterinario. |
| Prelievo a casa e spedizione | Il kit contiene istruzioni chiare su che cosa fare con il campione e come inviarlo? | La procedura del laboratorio ha sempre la precedenza sui consigli generali. Un campione trattato male è una base meno affidabile. |
| Tempi di elaborazione | Dopo quanto tempo dall’arrivo del campione arriva il risultato? | La velocità non è il criterio principale, ma è bene sapere in anticipo quando aspettarsi il risultato e quando potrai discuterne con il veterinario. |
| Nessuna diagnosi | Il test sostiene di individuare una malattia o promette una guarigione? | La disbiosi descrive lo stato dei batteri, non è la diagnosi di una malattia. Un test serio non dovrebbe presentarsi come un esame veterinario. |
| Ripetizione | Il test si può ripetere in seguito con lo stesso metodo? | Il microbioma oscilla naturalmente nel tempo (Rojas et al., 2026), perciò l’andamento nello stesso laboratorio dice più di una singola misurazione. |
Come funzionano da noi il prelievo, il risultato e la spiegazione lo trovi nella pagina Test del microbioma del cane. Qui trovi piuttosto una guida per confrontare in autonomia offerte simili.
Come prepararsi al prelievo?
Prima del prelievo annota che cosa il cane assume e mangia e segui con precisione le istruzioni del laboratorio. Antibiotici, probiotici e cambi di alimentazione possono spostare il risultato, perciò parlane con il laboratorio e con il veterinario.
- Annota i farmaci. Gli antibiotici possono cambiare i batteri intestinali per un periodo piuttosto lungo: nei cani sani, dopo 14 giorni di metronidazolo i cambiamenti non erano del tutto risolti nemmeno quattro settimane dopo la sospensione (Pilla et al., 2020). Annota il nome del farmaco e quando il cane ha finito la cura.
- Annota probiotici e altri integratori. Non decidere di tua iniziativa di sospenderli. Se vanno sospesi prima del prelievo, lo decidono il laboratorio e il veterinario, in base a ciò che volete scoprire.
- Annota i cambi di alimentazione. In uno studio, dopo il passaggio graduale dei cani sani dalle crocchette a un’alimentazione ricca di carne bovina cotta la composizione dei batteri nelle feci è cambiata e con il ritorno alle crocchette è in gran parte tornata allo stato iniziale (Herstad et al., 2017). Se nelle ultime settimane l’alimentazione è cambiata, segnalalo.
- Preleva un campione fresco. Fallo a casa, nel kit di prelievo, esattamente secondo le istruzioni, e spediscilo al laboratorio.
I requisiti precisi variano da laboratorio a laboratorio, quindi le istruzioni sulla confezione hanno sempre la precedenza sul consiglio generico.
Perché un solo risultato non basta?
Il microbioma di un cane sano cambia naturalmente nel tempo, quindi una sola misurazione mostra soltanto un giorno. Solo la ripetizione nello stesso laboratorio mostra se si tratta di uno scostamento duraturo o della normale oscillazione.
Uno studio su 35 cani sani, a cui i ricercatori hanno prelevato le feci ogni mese per uno o due anni, ha mostrato che ogni cane manteneva il proprio profilo tipico, ma che il suo microbioma oscillava in modo marcato nel tempo. Alcuni batteri, come Escherichia coli, erano tra i più variabili, altri, come Peptacetobacter hiranonis, erano più stabili (Rojas et al., 2026).
- Misura nello stesso laboratorio. Altrimenti confronti due metodi diversi, non due stati dell’intestino.
- Leggi la tendenza, non un solo numero. Conta di più la direzione del cambiamento che una piccola deviazione.
Come lavorare con il veterinario sul risultato?
Porta il risultato al veterinario insieme a ciò che osservi nel cane, perché hanno senso solo insieme. Il laboratorio descrive i batteri, il veterinario valuta il cane e decide i passi successivi.
- Porta la documentazione. Il referto del laboratorio, l’elenco di farmaci e integratori, i dati sull’alimentazione e un breve diario di feci e appetito.
- Chiedi cosa collega il referto al cane. Che cosa nel referto corrisponde ai problemi del cane e che cosa è solo uno scostamento?
- Concorda il passo successivo. Il veterinario può consigliare altri esami, una modifica dell’alimentazione o un prelievo di controllo.
- Scegli i probiotici in base ai dati. Se il veterinario consiglia i probiotici, il risultato può servire da base per la scelta, al posto dell’intuito. Studi sui cani che dimostrino che la scelta in base all’analisi funzioni meglio, però, per ora mancano.
Che cosa chiedere al laboratorio
- Con quale metodo analizza il campione?
- Con che cosa confronta il risultato, cioè con quali valori di cani sani?
- Quanto tempo richiedono i risultati e chi li interpreta?
- Che cosa devo dire al laboratorio prima del prelievo (farmaci, alimentazione, integratori)?
Un buon laboratorio te lo spiegherà volentieri. Che cos’è il microbioma del cane lo trovi nell’articolo Il microbioma del cane: cos’è e perché è importante.
Domande frequenti
Il test del microbioma riconosce le malattie del cane?
No. Il test mostra quali batteri vivono nell’intestino e se la loro composizione differisce da quella dei cani sani. La disbiosi però è solo un indizio, non una malattia, e cambiamenti simili possono avere più cause. La diagnosi la stabilisce solo il veterinario, insieme ai sintomi e agli altri esami. Il risultato del test può servirgli come ulteriore elemento.
Come si fa il test del microbioma nel cane?
Da un campione di feci fresche. Lo prelevi a casa nel kit di prelievo seguendo con precisione le istruzioni del laboratorio e lo spedisci per l’analisi. Prima annota farmaci, integratori e cambi di alimentazione, perché influenzano il risultato. Il risultato lo ricevi sotto forma di referto sulla composizione del microbioma, che è bene discutere con il veterinario.
Perché i risultati di laboratori diversi differiscono?
I metodi di sequenziamento per ora non sono uniformi e differiscono nella procedura e nella valutazione. Finora non è stato nemmeno verificato quanto siano riproducibili i loro risultati e i laboratori differiscono anche nel modo di presentarli. I risultati di due laboratori non si possono quindi confrontare semplicemente, e le misurazioni ripetute è meglio farle nello stesso laboratorio.
Qual è la differenza tra sequenziamento 16S rRNA, metagenomica shotgun e qPCR?
Il sequenziamento 16S rRNA legge un solo gene dei batteri e stabilisce quali batteri ci sono nel campione e in che proporzione. La metagenomica shotgun legge tutto il DNA, quindi coglie anche i batteri meno rappresentati e le loro possibili funzioni. La qPCR con Dysbiosis Index conta soltanto la quantità totale di batteri e sette gruppi selezionati e li confronta con i valori dei cani sani.
Prima del prelievo devo sospendere i probiotici al cane o cambiare alimentazione?
Non cambiare nulla di tua iniziativa. Di’ al veterinario e al laboratorio che cosa il cane assume e che cosa gli dai da mangiare e segui le loro indicazioni. Antibiotici, probiotici e cambi di alimentazione possono influenzare la composizione del microbioma, gli antibiotici anche per alcune settimane. Se sospendere un integratore prima del prelievo lo decide il veterinario, in base a ciò che volete scoprire.
Ogni quanto ripetere il test?
Dipende dal motivo del test. Il microbioma di un cane sano oscilla naturalmente nel tempo, perciò una sola misurazione è solo un’istantanea di un giorno. Pianifica il controllo con il veterinario, per esempio alcune settimane dopo un cambio di alimentazione o dopo una terapia, e misura nello stesso laboratorio. Conta più la direzione del cambiamento che un singolo numero.
Che differenza c’è tra un test del microbioma e l’esame delle feci per i parassiti?
L’esame delle feci per i parassiti cerca uova, cisti o antigeni di parassiti, per esempio della Giardia. Il test del microbioma descrive la composizione dei batteri intestinali e non è pensato per cercare parassiti. L’uno non sostituisce l’altro e un singolo riscontro negativo non esclude i parassiti, perciò in presenza di disturbi il veterinario valuta di ripetere il prelievo (Merck Veterinary Manual).
Fonti
- Suchodolski JS (2021). Analysis of the gut microbiome in dogs and cats. Veterinary Clinical Pathology. doi.org/10.1111/vcp.13031
- AlShawaqfeh MK et al. (2017). A dysbiosis index to assess microbial changes in fecal samples of dogs with chronic inflammatory enteropathy. FEMS Microbiology Ecology. doi.org/10.1093/femsec/fix136
- Herstad KMV et al. (2017). A diet change from dry food to beef induces reversible changes on the faecal microbiota in healthy, adult client-owned dogs. BMC Veterinary Research. doi.org/10.1186/s12917-017-1073-9
- Pilla R et al. (2020). Effects of metronidazole on the fecal microbiome and metabolome in healthy dogs. Journal of Veterinary Internal Medicine. doi.org/10.1111/jvim.15871
- Durazzi F et al. (2021). Comparison between 16S rRNA and shotgun sequencing data for the taxonomic characterization of the gut microbiota. Scientific Reports. doi.org/10.1038/s41598-021-82726-y
- Rojas CA et al. (2026). Temporal variability is an inherent feature of the healthy canine microbiome assessed by full-length 16S rRNA gene sequencing. Animal Microbiome. doi.org/10.1186/s42523-026-00546-9
- Merck Veterinary Manual. Diagnostic Procedures for the Private Practice Laboratory: Parasitology (esame delle feci, Giardia, esame ripetuto). merckvetmanual.com
L’articolo ha scopo educativo e non sostituisce la visita veterinaria. Se hai dei dubbi, consulta il veterinario.
L’articolo è stato rivisto con l’aiuto dell’IA. Si tratta di una traduzione dal ceco, quindi può contenere imprecisioni.