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Mikrobiom-Analyse beim Hund: was das Ergebnis zeigt
Ein Mikrobiomtest beim Hund zeigt die Bakterien im Kot, keine Diagnose. So wählst du den Test, bereitest die Probe vor und liest das Ergebnis mit dem Tierarzt.

Ein Mikrobiom-Test für den Hund ist heute für fast jeden zugänglich: Du schickst eine Kotprobe per Post, und nach ein paar Wochen kommt ein Bericht voller lateinischer Namen. Bevor du loslegst, lohnt es sich zu wissen, was du daraus lesen kannst. Dazu gehört ehrlicherweise auch, was die Analyse nicht kann.
- Ein Mikrobiom-Test aus dem Kot des Hundes zeigt, welche Bakterien im Darm leben und ob sich ihre Zusammensetzung von der gesunder Hunde unterscheidet.
- Das Ergebnis ist keine Diagnose und ersetzt den Tierarzt nicht, sondern ist eine Grundlage für das Gespräch mit deinem Tierarzt.
- Labore nutzen drei Hauptmethoden (16S-rRNA-Sequenzierung, Shotgun-Metagenomik und qPCR mit dem Dysbiosis Index), und ihre Ergebnisse lassen sich nicht einfach vergleichen.
- Sag vor der Probenentnahme dem Labor und dem Tierarzt, ob dein Hund Antibiotika oder Probiotika bekommen hat oder das Futter gewechselt wurde, denn das beeinflusst das Ergebnis.
- Prüfe bei der Wahl eines Tests die Methode, den Vergleich mit gesunden Hunden, wer das Ergebnis erklärt und ob der Test keine Diagnose behauptet. Ein Ergebnis ist außerdem eine Momentaufnahme eines einzelnen Tages, deshalb verfolge die Entwicklung im selben Labor.
Was die Analyse zeigt
Die Kotanalyse beschreibt die Zusammensetzung der Darmbakterien deines Hundes am Tag der Probenentnahme. Für das Gespräch mit dem Tierarzt ist das eine nützliche Grundlage.
- Wer im Darm lebt. Welche Bakterien im Darm vorkommen, wie vielfältig ihre Gemeinschaft ist und was sie leisten könnten.
- Abweichung von der üblichen Zusammensetzung. Das nennt man Dysbiose. Tierärzte nutzen dafür zum Beispiel den Dysbiosis Index, der die Gesamtmenge der Bakterien und 7 Schlüsselgruppen misst und mit den Werten gesunder Hunde vergleicht.
- Wie sich das Mikrobiom mit der Zeit verändert. Wiederholte Messungen zeigen die Entwicklung, etwa nach einem Futterwechsel oder nach einer Behandlung.
Was die Analyse nicht zeigt
- Eine Diagnose. Dysbiose ist ein Hinweis, keine Krankheit. Ähnliche Veränderungen kann Verschiedenes verursachen.
- Einen Ersatz für den Tierarzt. Das Ergebnis ist nur zusammen mit den Symptomen und weiteren Untersuchungen sinnvoll zu deuten.
- Parasiten. Ein Mikrobiomtest ist nicht dafür gedacht, Parasiten zu finden. Für Eier und Zysten dient die Kotuntersuchung, bei Giardien auch ein Test aus einer Kotprobe (Merck Veterinary Manual).
- Einen einfachen Vergleich zwischen Laboren. Die Sequenzierungsmethoden sind noch nicht einheitlich, deshalb lassen sich die Ergebnisse zweier verschiedener Labore nicht einfach vergleichen.
Welche Methoden nutzen die Labore?
Hundekot analysieren Labore am häufigsten auf drei Arten: mit der Sequenzierung des 16S-rRNA-Gens, mit Shotgun-Metagenomik und mit quantitativer PCR (qPCR) samt Dysbiosis Index. Sie unterscheiden sich darin, wie tief sie hineinschauen und womit sie das Ergebnis vergleichen.
Die 16S-rRNA-Sequenzierung liest bei jedem Bakterium nur ein gemeinsames Gen, eine Art „Namensschild an der Klingel“. Die Shotgun-Metagenomik liest die gesamte DNA in der Probe. Die qPCR sucht nicht nach allen Bakterien, sondern zählt nur vorher ausgewählte Gruppen.
| Methode | Was sie misst | Stärke | Einschränkung |
|---|---|---|---|
| 16S-rRNA-Sequenzierung | Ein Gen aller Bakterien, das Ergebnis ist eine Liste der Bakterien und ihr relativer Anteil | Breiter Überblick | Die Verfahren sind nicht vereinheitlicht, sie erfasst vor allem häufigere Bakterien |
| Shotgun-Metagenomik | Die gesamte DNA in der Probe, also Bakterien und ihre Gene | Erfasst auch seltenere Bakterien und mögliche Funktionen | Teurer, ebenfalls ohne einheitliche Verfahren |
| qPCR mit Dysbiosis Index | Die Gesamtmenge der Bakterien und 7 ausgewählte Gruppen, das Ergebnis ist eine einzige Zahl | Hat einen Referenzbereich gesunder Hunde | Zeigt keine Bakterien außerhalb der ausgewählten Gruppen |
Laut einer Übersicht zur Analyse des Hunde-Mikrobioms unterscheiden sich die Methoden darin, was sie erfassen können (Suchodolski, 2021). Ähnlich erfasste die 16S-Sequenzierung bei Hühnerdarmproben (die Daten stammen nicht von Hunden) nur einen Teil der Gemeinschaft, den die Shotgun-Metagenomik aufdeckte, vor allem bei weniger häufigen Bakterien (Durazzi et al., 2021). Der Dysbiosis Index wurde dagegen direkt an Hunden überprüft: In einer Arbeit mit Proben von 95 gesunden Hunden und 106 Hunden mit chronisch-entzündlicher Darmerkrankung erkannte er 95 % der gesunden und 74 % der kranken Hunde richtig (AlShawaqfeh et al., 2017).
Was bedeuten die Begriffe im Ergebnis?
Der Bericht des Labors enthält meist Vielfalt, relativen Anteil und die Bewertung der Dysbiose. Jeder dieser Begriffe bedeutet etwas anderes, und eine Zahl allein ohne Zusammenhang sagt nichts.
- Vielfalt (Diversität) gibt an, wie viele verschiedene Bakterien im Darm leben und wie ausgewogen sie vertreten sind. Eine höhere Zahl bedeutet für sich genommen keine bessere Gesundheit. Bei gesunden Hunden ging nach 14 Tagen Metronidazol (ein Antibiotikum) der Artenreichtum der Darmbakterien deutlich zurück (Pilla et al., 2020).
- Relativer Anteil ist der Anteil eines Bakteriums an der Gesamtzahl, zum Beispiel 12 %. Er sagt nicht, wie viele Bakterien genau im Darm sind, sondern nur, wie groß ihr Anteil am Ganzen ist. Wächst eine Gruppe, sinkt der Anteil der anderen automatisch.
- Dysbiose ist ein Ungleichgewicht der Darmbakterien, bei dem sich Zusammensetzung oder Funktion der Gemeinschaft im Vergleich zu gesunden Hunden verändern (Suchodolski, 2021). Sie beschreibt einen Zustand, ist keine Diagnose und kein Beweis für eine Krankheit.
- Dysbiosis Index fasst das Ergebnis der qPCR in einer Zahl zusammen: Ein negativer Wert steht für die übliche Zusammensetzung, ein positiver für Dysbiose (AlShawaqfeh et al., 2017).
Wann ein Test sinnvoll ist
- Verdauungsbeschwerden kehren immer wieder. Der Kot ist wiederholt weich, und du suchst mit dem Tierarzt schon nach der Ursache. Das Ergebnis liefert ihm eine weitere Grundlage. Mehr dazu findest du in den Artikeln Hundekot: Farbe, Form und Konsistenz und Weicher Kot beim Hund.
- Nach Antibiotika. Du möchtest wissen, wie sich der Darm nach der Behandlung erholt. Siehe Hund nach Antibiotika.
- Futterwechsel. Wiederholte Messungen zeigen, wie sich das Mikrobiom nach der Umstellung der Ernährung entwickelt. Siehe Futterumstellung beim Hund.
- Auswahl von Probiotika. Du möchtest nach Daten auswählen und nicht danach, was gerade im Angebot ist. Siehe Probiotika für Hunde: was sie sind und wie du wählst.
Wie wählst du einen Mikrobiomtest für Hunde aus?
Prüfe bei der Wahl eines Mikrobiomtests für Hunde die Methode, mit welchen Werten das Labor das Ergebnis vergleicht, was der Bericht enthält, wer ihn dir erklärt, wie Probenentnahme und Versand ablaufen und ob der Test keine Diagnose behauptet. Hol dir die Antworten vorher ein, nicht erst nach der Bestellung.
| Kriterium | Wonach du fragen solltest | Warum es wichtig ist |
|---|---|---|
| Methode | 16S-rRNA-Sequenzierung, Shotgun-Metagenomik oder qPCR mit dem Dysbiosis Index? | Die Methoden sehen Unterschiedliches, und ihre Ergebnisse lassen sich nicht einfach vergleichen (Suchodolski, 2021). Das Labor sollte seine Methode klar angeben. |
| Vergleich mit einer Referenzgruppe | Mit welchen Werten gesunder Hunde wird dein Hund verglichen? | Für den Dysbiosis Index sind Referenzbereiche für Hunde festgelegt (Suchodolski, 2021). Eine Liste von Bakterien ohne Vergleich ist schwer zu lesen. |
| Inhalt des Berichts | Enthält er Vielfalt, Anteile der Bakteriengruppen und Erklärungen der Begriffe, oder nur eine einzige Zahl? | Vielfalt, Anteile und die Bewertung der Dysbiose bedeuten jeweils etwas anderes. Eine einzelne Zahl ohne Zusammenhang reicht nicht. |
| Wer das Ergebnis erklärt | Bekommst du eine Erklärung von einer Fachperson oder nur einen Bericht voller lateinischer Namen? | Das Ergebnis ergibt nur zusammen mit den Symptomen deines Hundes Sinn. Am Ende gehst du es ohnehin mit dem Tierarzt durch. |
| Probenentnahme zu Hause und Versand | Liegt dem Set eine verständliche Anleitung bei, was du mit der Probe tun und wie du sie verschicken sollst? | Das Verfahren des Labors hat immer Vorrang vor allgemeinen Ratschlägen. Eine Probe, mit der falsch umgegangen wurde, ist eine schlechtere Grundlage. |
| Bearbeitungszeit | Wie lange nach Eingang der Probe kommt das Ergebnis? | Die Geschwindigkeit ist nicht das wichtigste Kriterium, aber du solltest vorher wissen, wann du das Ergebnis erwarten und mit dem Tierarzt besprechen kannst. |
| Keine Diagnose | Behauptet der Test, eine Krankheit festzustellen, oder verspricht er Heilung? | Dysbiose beschreibt den Zustand der Bakterien, sie ist keine Diagnose einer Krankheit. Ein seriöser Test sollte sich nicht als tierärztliche Untersuchung ausgeben. |
| Wiederholung | Lässt sich der Test später mit derselben Methode wiederholen? | Das Mikrobiom schwankt im Lauf der Zeit ganz natürlich (Rojas et al., 2026), deshalb sagt der Verlauf im selben Labor mehr aus als eine einzelne Messung. |
Wie Probenentnahme, Ergebnis und Erklärung bei uns aussehen, findest du auf der Seite Mikrobiomtest für Hunde. Hier geht es eher darum, wie du ähnliche Angebote selbst vergleichen kannst.
Wie bereitest du dich auf die Probenentnahme vor?
Notiere vor der Probenentnahme, was dein Hund bekommt und frisst, und halte dich genau an die Anleitung des Labors. Antibiotika, Probiotika und ein Futterwechsel können das Ergebnis verschieben, sag deshalb dem Labor und dem Tierarzt Bescheid.
- Notiere Medikamente. Antibiotika können die Darmbakterien für längere Zeit verändern: Bei gesunden Hunden waren die Veränderungen nach 14 Tagen Metronidazol auch vier Wochen nach dem Absetzen nicht ganz verschwunden (Pilla et al., 2020). Notiere den Namen des Medikaments und wann dein Hund es zuletzt bekommen hat.
- Notiere Probiotika und weitere Ergänzungen. Setze sie nicht ohne Rücksprache ab. Ob du sie vor der Probenentnahme weglassen sollst, entscheiden Labor und Tierarzt danach, was du konkret herausfinden willst.
- Notiere einen Futterwechsel. In einer Studie veränderte sich nach der schrittweisen Umstellung gesunder Hunde von Trockenfutter auf eine Ernährung mit hohem Anteil an gekochtem Rindfleisch die Zusammensetzung der Bakterien im Kot und kehrte nach der Rückkehr zum Trockenfutter größtenteils in den ursprünglichen Zustand zurück (Herstad et al., 2017). Wenn sich das Futter in den letzten Wochen geändert hat, gib das an.
- Nimm eine frische Probe. Sammle sie zu Hause genau nach Anleitung mit dem Entnahmeset und schicke sie an das Labor.
Die genauen Anforderungen unterscheiden sich von Labor zu Labor, deshalb hat die Anleitung auf der Packung immer Vorrang vor allgemeinen Ratschlägen.
Warum reicht ein einzelnes Ergebnis nicht?
Das Mikrobiom eines gesunden Hundes verändert sich im Lauf der Zeit ganz natürlich, deshalb zeigt eine einzelne Messung nur einen Tag. Erst die Wiederholung im selben Labor zeigt, ob es sich um eine dauerhafte Abweichung oder um normale Schwankungen handelt.
Eine Studie mit 35 gesunden Hunden, denen Forschende ein bis zwei Jahre lang jeden Monat Kot abnahmen, zeigte, dass jeder Hund sein typisches Profil behielt, sein Mikrobiom aber im Lauf der Zeit deutlich schwankte. Manche Bakterien, zum Beispiel Escherichia coli, gehörten zu den veränderlichsten, andere, zum Beispiel Peptacetobacter hiranonis, waren stabiler (Rojas et al., 2026).
- Miss im selben Labor. Sonst vergleichst du zwei verschiedene Methoden und nicht zwei Zustände des Darms.
- Lies den Trend, nicht eine einzelne Zahl. Wichtiger ist die Richtung der Veränderung als eine kleine Abweichung.
Wie besprichst du das Ergebnis mit dem Tierarzt?
Bring das Ergebnis zusammen mit dem, was du bei deinem Hund beobachtest, zum Tierarzt, denn nur zusammen ergeben sie einen Sinn. Das Labor beschreibt die Bakterien, der Tierarzt beurteilt den Hund und entscheidet über die nächsten Schritte.
- Bring die Unterlagen mit. Den Bericht des Labors, eine Liste der Medikamente und Ergänzungen, Angaben zum Futter und eine kurze Notiz zu den Häufchen und zum Appetit.
- Frag nach Zusammenhängen. Was im Bericht passt zu den Beschwerden des Hundes und was ist nur eine Abweichung?
- Besprich das weitere Vorgehen. Der Tierarzt kann weitere Untersuchungen, eine Anpassung des Futters oder eine Kontrollprobe empfehlen.
- Wähle Probiotika nach Daten. Wenn der Tierarzt Probiotika empfiehlt, kann das Ergebnis statt einer Schätzung als Grundlage für die Auswahl dienen. Studien, die bei Hunden zeigen, dass die Auswahl nach einer Analyse besser funktioniert, fehlen aber noch.
Was du das Labor fragen kannst
- Mit welcher Methode wird die Probe analysiert?
- Womit wird das Ergebnis verglichen, also mit welchen Werten gesunder Hunde?
- Wie lange dauert es, bis die Ergebnisse da sind, und wer erklärt sie?
- Was muss ich dem Labor vor der Probenentnahme sagen (Medikamente, Futter, Ergänzungen)?
Ein gutes Labor erklärt dir das gern. Was das Hunde-Mikrobiom ist, findest du im Artikel Hunde-Mikrobiom: was es ist und warum es wichtig ist.
Häufige Fragen
Erkennt ein Mikrobiom-Test beim Hund eine Krankheit?
Nein. Der Test zeigt, welche Bakterien im Darm leben und ob sich ihre Zusammensetzung von der gesunder Hunde unterscheidet. Dysbiose ist aber nur ein Hinweis, keine Krankheit, und ähnliche Veränderungen kann Verschiedenes verursachen. Eine Diagnose stellt nur der Tierarzt, zusammen mit den Symptomen und weiteren Untersuchungen. Das Testergebnis kann ihm als weitere Grundlage dienen.
Wie wird ein Mikrobiom-Test beim Hund gemacht?
Aus einer frischen Kotprobe. Du sammelst sie zu Hause genau nach der Anleitung des Labors mit dem Entnahmeset und schickst sie zur Analyse ein. Notiere vorher Medikamente, Ergänzungen und Futterwechsel, denn sie beeinflussen das Ergebnis. Das Ergebnis bekommst du als Bericht über die Zusammensetzung des Mikrobioms, den du am besten mit dem Tierarzt besprichst.
Warum unterscheiden sich die Ergebnisse verschiedener Labore?
Die Sequenzierungsmethoden sind noch nicht einheitlich und unterscheiden sich in Verfahren und Auswertung. Bisher wurde auch nicht überprüft, wie genau sich ihre Ergebnisse wiederholen lassen, und die Labore unterscheiden sich auch darin, wie sie die Ergebnisse darstellen. Die Ergebnisse zweier Labore lassen sich deshalb nicht einfach vergleichen, und wiederholte Messungen machst du am besten im selben Labor.
Was ist der Unterschied zwischen 16S-rRNA-Sequenzierung, Shotgun-Metagenomik und qPCR?
Die 16S-rRNA-Sequenzierung liest ein Gen der Bakterien und bestimmt, welche Bakterien in der Probe sind und welchen Anteil sie haben. Die Shotgun-Metagenomik liest die gesamte DNA und erfasst deshalb auch weniger häufige Bakterien und ihre möglichen Funktionen. Die qPCR mit Dysbiosis Index zählt nur die Gesamtmenge der Bakterien und sieben ausgewählte Gruppen und vergleicht sie mit den Werten gesunder Hunde.
Soll ich vor der Probenentnahme Probiotika absetzen oder das Futter ändern?
Ändere nichts auf eigene Faust. Sag dem Tierarzt und dem Labor, was dein Hund bekommt und womit du ihn fütterst, und richte dich nach ihren Anweisungen. Antibiotika, Probiotika und ein Futterwechsel können die Zusammensetzung des Mikrobioms beeinflussen, Antibiotika sogar für mehrere Wochen. Ob du eine Ergänzung vor der Probenentnahme weglassen sollst, entscheidet der Tierarzt danach, was ihr herausfinden wollt.
Wie oft sollte ich den Test wiederholen?
Das hängt vom Grund des Tests ab. Das Mikrobiom eines gesunden Hundes schwankt im Lauf der Zeit ganz natürlich, deshalb ist eine Messung nur eine Momentaufnahme eines Tages. Plane eine Kontrolle mit dem Tierarzt, zum Beispiel einige Wochen nach einem Futterwechsel oder nach einer Behandlung, und miss im selben Labor. Wichtiger ist die Richtung der Veränderung als eine einzelne Zahl.
Was ist der Unterschied zwischen einem Mikrobiomtest und einer Kotuntersuchung auf Parasiten?
Die Kotuntersuchung auf Parasiten sucht nach Eiern, Zysten oder Antigenen von Parasiten, zum Beispiel von Giardien. Ein Mikrobiomtest beschreibt die Zusammensetzung der Darmbakterien und ist nicht dafür gedacht, Parasiten zu finden. Das eine ersetzt das andere nicht, und ein einzelner negativer Befund schließt Parasiten nicht aus, deshalb erwägt der Tierarzt bei Beschwerden eine wiederholte Probenentnahme (Merck Veterinary Manual).
Quellen
- Suchodolski JS (2021). Analysis of the gut microbiome in dogs and cats. Veterinary Clinical Pathology. doi.org/10.1111/vcp.13031
- AlShawaqfeh MK et al. (2017). A dysbiosis index to assess microbial changes in fecal samples of dogs with chronic inflammatory enteropathy. FEMS Microbiology Ecology. doi.org/10.1093/femsec/fix136
- Herstad KMV et al. (2017). A diet change from dry food to beef induces reversible changes on the faecal microbiota in healthy, adult client-owned dogs. BMC Veterinary Research. doi.org/10.1186/s12917-017-1073-9
- Pilla R et al. (2020). Effects of metronidazole on the fecal microbiome and metabolome in healthy dogs. Journal of Veterinary Internal Medicine. doi.org/10.1111/jvim.15871
- Durazzi F et al. (2021). Comparison between 16S rRNA and shotgun sequencing data for the taxonomic characterization of the gut microbiota. Scientific Reports. doi.org/10.1038/s41598-021-82726-y
- Rojas CA et al. (2026). Temporal variability is an inherent feature of the healthy canine microbiome assessed by full-length 16S rRNA gene sequencing. Animal Microbiome. doi.org/10.1186/s42523-026-00546-9
- Merck Veterinary Manual. Diagnostic Procedures for the Private Practice Laboratory: Parasitology (Kotuntersuchung, Giardia, wiederholte Untersuchung). merckvetmanual.com
Der Artikel dient der Aufklärung und ersetzt keine tierärztliche Untersuchung. Wenn du dir unsicher bist, sprich mit dem Tierarzt.
Der Artikel wurde mit Hilfe von KI korrekturgelesen. Es handelt sich um eine Übersetzung aus dem Tschechischen, daher kann sie Ungenauigkeiten enthalten.